El humedal alberga, aproximadamente, a 128 especies de aves entre residentes y migratorias.
El Yali fue declarado en la categoría de reserva nacional el 23 de mayo de 1996 (DS 41), con el objeto de proteger y conservar en su medio natural el ambiente lacustre, la flora y fauna silvestre asociada a este sitio. Asimismo, fue designado sitio Ramsar (humedal de importancia internacional) con el número 878, el 2 de diciembre de 1996.

La Reserva Nacional El Yali posee una superficie de 520 hectáreas, se localiza en la Región de Valparaíso, provincia de San Antonio, comuna de Santo Domingo, a 38 km al sur del balneario Rocas de Santo Domingo. La conforman las lagunas Matanza, Colejuda y Albufera o laguna Costera.

Además de formar parte del humedal El Yali, zona conformada por dieciocho cuerpos o cursos de agua distribuidos en el territorio, entre lagunas, esteros, ríos, embalses y desembocaduras, que en su totalidad abarcan una superficie de 11 500 hectáreas y pertenece al complejo de ciencuenta y ocho humedales desde Algarrobo al río Rapel, la Reserva Nacional El Yali presenta un relieve que se caracteriza por planicies costeras, gran parte de ellas representadas por dunas estabilizadas con cubierta vegetal, constituida por especies introducidas, como pino y eucalipto, así como por matorral nativo, principalmente romerillo, vautro y espino.